军事法院和军事政法委是不同性质的机构，承担着不同的职责。

军事法院是设立在军队中的审判机关，属于国家审判体系重要组成部分。它主要负责审判现役军人、军队在编职工刑事案件，依照法律规定由它管辖民事案件等。通过行使审判权，维护军队的法治秩序，保障军队人员的合法权益，确保军事司法公正和权威。

军事政法委全称为中央军委政法委员会，是军委会管理军队政法工作职能部门。是加强军委对军队政法工作的领导，统筹协调各方面资源，指导和推动军队法治建设、政法工作开展，维护军队政治安全和部队高度集中统一。


军事法院接受军事政法委的领导和指导。军事政法委从宏观层面进行政策制定、工作指导和协调，为军事法院的工作提供方向和支持。而军事法院则依据法律规定独立行使审判权，在具体司法审判工作中保持相对的独立性，严格按照法定程序和法律规定进行案件审理。


军事法院在司法审判领域具有不可替代的作用，它通过公正的审判活动，解决军事领域的各类纠纷和犯罪问题，保障军事法律的正确实施，对于维护军队的纪律和法治环境至关重要。


军事政法委在统筹政法工作全局方面发挥着关键作用。它能够整合军队内部政法资源，协调各政法部门之间工作关系，确保军队政法工作高效有序开展，为军队建设和发展创造良好法治环境。